【Serumwerk】从原生动物和变形虫(Protozoa and amoebae)中分离细胞器(Cell crgan)
从原生动物和变形虫中分离细胞器不成功、实验做不出来怎么办?新手小白迫切求助,希望各位前辈在文章下方留言,分享自己的经验,为小白们答疑解惑!
氢化基因组(Hydrogenomes)分离
变形鞭毛虫 阿米巴原虫(Flagellate metformans, amoebisp)分离
将覆盖15-40%范围的不连续碘二醇在100,000 g下离心过夜,分解氢化体组分。
毛滴虫属(Trichomonas)分离
从毛滴虫核后上清液中,通过17000 g离心20 min,制备粗制的阴道毛滴虫氢酶体(在0.25 M蔗糖,0.5 mM KCl, 10 mM Tris-HCl, pH 7.2和常见蛋白酶抑制剂中进行超声匀浆)。连续(18-36% w/v碘克沙醇)或在相同浓度范围内不连续(以2%步骤进行)。在50% (w/v)碘克沙醇中对样品进行底层分层并且在200,000 g下离心2 h。在约30% (w/v)碘克沙醇条带化的氢酶体。在Kay等人发表的一种替代方法中,粗组分被悬浮在0.25 M蔗糖,20 mM HEPES, 5 mM DTT中,含有6% (w/v)碘克沙醇和通常的蛋白酶抑制剂,并在12-24% (w/v)碘克沙醇梯度上分层,70,000 g离心2小时。氢酶体的条带位置由其特征的浅棕色确定。最近,将15,000 g颗粒在200,000 g下在不连续的12-30%碘克沙醇梯度中分馏12 h。
梨形鞭毛虫属(Giardia)分离
贾第鞭毛虫含有溶酶体样细胞器,与哺乳动物溶酶体一样,其密度相对较低。当100,000 g的核后上清(由贾第鞭毛虫的超声裂解物制备)在1.05-1.25 g/ml Nycodenz®梯度中分离时,离心后细胞器条带在约在1.07 g/ml。15万g 2.5小时Jedelský等使用不连续的OptiPrepTM梯度(15%,20%,25%,30%和50%)在12万g离心24小时来分离贾第鞭毛虫匀浆的研究表明,与哺乳动物线粒体相比,贾第鞭毛虫线粒体的蛋白质组减少。作者的结论是,这是由于环境中的低氧含量,这需要减少一系列的代谢过程。
草履虫(Paramecia)分离
在陷阱蛋白分布研究中,在46000g条件下,在10-30%(w/v)碘二醇梯度上分离18小时
弓形虫(Toxoplasma)分离
将宿主细胞分离以研究空泡的细胞器关联:将细胞的轻线粒体部分调整为20% (w/v)碘克沙醇,并在小体积近垂直的转子中通过180,000 g离心4 h形成自我生成的梯度。最近,从弓形虫速殖子中分离出的“植物样液泡”不连续梯度为15%、20%(含“微粒体部分”)、25%、30%、34%和38%碘克沙醇,并在50000 g离心1小时。液泡条带靠近梯度的顶部。
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