【Serumwerk】呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus)纯化
呼吸道合胞病毒纯化不成功、实验做不出来怎么办?新手小白迫切求助,希望各位前辈在文章下方留言,分享自己的经验,为小白们答疑解惑!
溶液制备
A. OptiPrep™
B. 150 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl, pH 7.5
C. 存于溶液B中的50% (w/v) PEG6000
D. 1 M MgSO4, 0.25 M蔗糖,100 mM Tris-HCl, pH 7.5
E. 100 mM MgSO4, 0.25 M蔗糖,10 mM Tris-HCl, pH 7.5
F. 100mm MgSO4, 150mm NaCl, 50mm Tris-HCl, pH 7.5
试验方法
1.将5.2体积的OptiPrep™与0.6体积的溶液D和0.2体积的水混合,制备52% (w/v)的碘克沙醇溶液。用溶液E稀释部分52%的碘克沙醇溶液,制备36%和20% (w/v)碘克沙醇溶液。
2.3000 g离心20 min澄清含病毒培养液。
3.借由将溶液C添加至3000 g上清液(分别为1体积+ 4体积)中浓缩病毒并于4℃下轻轻搅拌90 min。
4.以3250 g将病毒离心20 min。
5.去除上清液并重新离心颗粒以去除剩余液体;将颗粒悬浮于1.0 ml F溶液中。
6.用三种碘克沙醇溶液(52%,36%和20%)各配制约4.0 ml的不连续梯度溶液,用于摆动式转子。
7.把病毒层放在梯度上,15万g离心90分钟。使用一个缓慢减速程序或允许转子从3000转,没有刹车减速。
8.在离心过程中,使用双腔梯度标记器或Gradient Master™从等体积(约5.5 ml)的20%和52%碘克沙醇中产生连续梯度。
9.从间断梯度的20-30%界面恢复病毒带,用2体积的F溶液稀释。
10.将病毒悬液层置于准备好的连续梯度上,以150,000 g离心18小时。使用缓慢减速程序或允许转子从3000转/分钟开始减速,而不使用刹车。
11.通过从半月板抽吸,用密集的介质向上移位或导管穿刺的方式收集梯度,并分析分数。
方法注释
1.将蔗糖溶液用0.1%焦碳酸二乙基(DEPC)在37℃处理24小时以使RNA酶失活,然后加热到60℃ 3天以去除DEPC。在此处理后检查pH值和溶液体积,如果需要重新调整。
2.3种碘克沙醇溶液必须配制足量,至少4个梯度;两个不连续的梯度和两个连续的梯度。如果没有用于制备连续梯度的设备(步骤8),则按照步骤6中的描述制备不连续梯度,并使其在4℃下扩散过夜。
3.此病毒收获将被重新加载到步骤10的第二个梯度上,因此其密度必须足够低,以允许此操作。当回收条带样品时,尽可能少的36%碘克沙醇层。
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