【Serumwerk】黄病毒科(Flaviviridae)——丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus)纯化
丙型肝炎病毒纯化不成功、实验做不出来怎么办?新手小白迫切求助,希望各位前辈在文章下方留言,分享自己的经验,为小白们答疑解惑!
01
溶液制备
病毒悬液
在通过3000-4000 g离心10 min和/或通过0.2或0.45 m过滤器过滤澄清含有病毒的液体后,通常需要在应用梯度之前浓缩病毒。直接从培养的悬浮液中造粒,Bartolomé等在100,000 gav下从超过10%蔗糖的血清中离心病毒颗粒17 h,也可以通过将病毒与0.25体积的40% (w/v)聚乙二醇8000在4℃ PBS中孵育过夜来从培养液中沉淀病毒。离心收集后的病毒悬浮于0.85% (w/v) NaCl、0.02%牛血清白蛋白、10 mM HEPES-NaOH、pH 7.55中;并在190,000 gav下通过离心6小时通过20% (w/v)碘克沙醇垫制成颗粒。
所需溶液
氯化钠作为渗透平衡剂
A. OptiPrep™
B. 缓冲液:120mm HEPES-NaOH, pH 7.6, 0.12% (w/v)牛血清白蛋白(BSA)
C. 盐溶液:1 M NaCl
用1体积的溶液B, 0.75体积的溶液C和3.25体积的水稀释1体积的OptiPrep™,制备10% (w/v)的碘克沙醇
将4体积的OptiPrep™用1体积的溶液B, 0.3体积的溶液C和0.7体积的水稀释,制备40% (w/v)的碘克沙醇。
蔗糖作为渗透平衡剂
A. OptiPrep™
B. 稀释剂1:0.25 M蔗糖,12 mM EDTA, 60 mM Tris-HCl, pH 8.0
C. 稀释剂2:0.25 M蔗糖,2 mM EDTA, 10 mM Tris-HCl 5 pH 8.0
通过将5体积的OptiPrep™与1体积的溶液A混合,制备50% (w/v)碘克沙醇。
用溶液C稀释50%碘克沙醇,得到较低浓度的碘克沙醇。
02
预形成梯度中沉降
试验方法
1.使用双腔梯度制造器或Gradient Master™从第3a节中描述的两种碘二醇溶液中制备约12毫升的梯度(用于约14毫升的摆动桶转子,例如14毫升管,贝克曼SW41Ti)。
2.将0.5-1.0 ml粗病毒悬液分层置于顶部,并在19,000 g下在4℃离心至少6 h。
3.通过导管穿刺或从半月板抽吸收集0.5-1.0 ml的梯度,如果病毒带足够明显,则使用注射器回收病毒。
方法注释
1.Lindenbach等人是第一个使用10-40%碘克沙醇梯度的小组,这种技术可能是应用最广泛的。虽然10 ~ 40%碘克沙醇是梯度的常见范围,但其他梯度也同样成功:10 ~ 50%、6 ~ 56%和20 ~ 50%用于净化重组杆状病毒感染的昆虫细胞释放的丙型肝炎病毒样颗粒。
2.如果没有用于创建连续梯度的机械设备,则从等体积的10%,20%,30%和40%组成一个不连续梯度。因为梯度至少离心6小时,这些不连续的梯度将在离心过程中通过扩散或多或少地成为线性(取决于梯度步骤的体积)。
3.偶有10-50%(或10-40%)碘克沙醇的不连续梯度仅用5%的步距产生。通常可使其在加载试样之前在4℃下扩散4-24 h,或可在没有任何扩散时间的情况下加载试样。有报道在90000 ~ 250000 g的g力下进行离心。此外,离心力和时间不一定与梯度的大小相关:实例为230,000 gav用于5 h (4 ml梯度)到90,000 gav用于24 h或190,000 gav用于6-16 h (12-13 ml梯度)。
03
预形成梯度中浮选
试验方法
1.使用缓冲液制备10%,20%,30%和40%碘克沙醇溶液;Tris缓冲的0.85% NaCl溶液。
2.在大约14ml的摇摆桶转子管中,使用连接在薄金属套管上的注射器,从每一种约3.0 ml的碘克沙醇溶液和缓冲盐水中制备梯度。
3.将病毒悬液与OptiPrep™混合,并在每个梯度下加入约1.0 ml的病毒悬液,将病毒悬液调整为约45%的碘克沙醇。
4.4℃下154,000 g离心16 h。
5.通过试管穿刺收集梯度,或者如果条带足够明确,使用注射器回收它。
方法注释
通过按比例减小所有体积,该方法可以缩小到较小体积的转子。在离心过程中,由于扩散,较小的梯度或多或少会变得连续。预先形成的连续梯度也可底部装载用于浮选分离,例如,在40%碘克沙醇中由丙型肝炎病毒下层形成8-30%碘克沙醇梯度。在这种情况下,病毒之前已经非常方便地浓缩在40%碘克沙醇缓冲液上。
04
自生成梯度
溶液制备
A. OptiPrep™
B. 缓冲液:0.25 M蔗糖,15 mM EDTA, 30 mM TrisHCl, pH 8.0
C. 组织溶解缓冲液:150 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl, pH 7.4, 0.2%牛血清白蛋白(BSA),根据需要在溶液C中添加蛋白酶抑制剂。
试验方法
1.将400-500毫克的肝脏匀浆于10毫升的溶液C中,使用紧密配合的Dounce匀浆器的杵多达60下。必须在隔离柜中进行,以避免接触气溶胶。
2.4℃ 8000 g离心5 min,然后将上清液通过0.45 m过滤器。
3.在用于所选转子的试管中混合4.2 ml OptiPrep™、3.3 ml溶液B和2.5 ml上清液。
4.在165,000 g的10 ml固定角度管离心机中,在4℃下24小时。
5.允许转子在2000转以下使用慢减速程序进行减速,或在2000转以下关闭制动器,然后收集梯度在0.5-0.7毫升的分数。
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