【Serumwerk】疱疹病毒科(Herpesviridae)纯化
疱疹病毒科纯化不成功、实验做不出来怎么办?新手小白迫切求助,希望各位前辈在文章下方留言,分享自己的经验,为小白们答疑解惑!
溶液制备
A. OptiPrep™
B. 稀释剂:0.85% (w/v) NaCl, 60 mM Hepes-NaOH, pH 7.4
C. 50%碘克沙醇(ρ = 1.272 g/ml)工作液:5体积溶液A与1体积溶液B混合。
D. HEPES缓冲盐水:0.85% NaCl (w/v),10 mM HEPES-NaOH, pH 7.4。
试验方法
1.通过1000 g离心10 min澄清病毒悬液。
2.将已知体积的上清液转移到适用于摆动桶转子的管道中,并在底部放置小体积(2-4 ml)溶液C。
3.以160,000 gav离心1小时,在工作溶液界面上快速抑制病毒。
4.除去除与缓冲液体积相等外的所有上清液,混合管中的剩余内容物。此将产生存于25% (w/v)碘克沙醇中的浓缩病毒悬液。
5.将悬浊液转移到适合垂直或接近垂直转子的管道中,使病毒在碘克沙醇的自生成梯度中条带。
6.任何未填充的管应加满并与25% (w/v)碘克沙醇混合(混合等体积的溶液C和D)。
7.在350,000 gav离心2.5小时,在离心结束时使用受控减速程序或在2000 rpm以下关闭制动器。
8.要么用注射器和金属套管获取病毒带,要么用导管穿刺卸载整个梯度,或其他合适的方法。在描述的离心条件下,疱疹病毒将带在管的底部三分之一。
方法注释
1.实际体积取决于病毒液的总体积和所用管的体积。例如:每管约15毫升上清液,使用1-2毫升缓冲液,35 ml使用2-4 ml。
2.由于接近梯度底部的病毒带和污染膜较轻,从底部收集是首选的方法。
3.大约2.5-3.5小时后,产生的梯度向顶部相对较浅,在密度较大的区域逐渐变陡。它能有效地使病毒在试管底部附近急剧凝集,而任何膜性污染条带的密度较低。在较短的时间内(例如1.5 h),病毒显带区域的梯度更呈s形且更浅;这允许病毒可能被细分。感染性特征中所见的肩关节在较短时间内变得更清楚。这种次分馏的意义尚未得到研究。
4.从碘克沙醇梯度收集的疱疹病毒(和星状病毒)已被用于重新感染细胞,而无需去除培养基。初步分析表明,回收率达到90%以上。
5.该方法可以扩大规模,以使用较大的垂直转子,如贝克曼VTi50,但较长的沉降路径和较低的最大RCF意味着需要更长的离心时间。
人疱疹病毒4型(Epstein-Barr virus)纯化
在50% (w/v)的碘克沙醇屏障上浓缩病毒,然后由25%碘克沙醇(350,000 g作用2.4小时)形成自生成梯度,以纯化和分析EB病毒。
杆状病毒群(Baculovirus)纯化
将病毒离心至50% (w/v)碘克沙醇垫层(80,000 g 1 h)后,去除病毒带上方的液体,并在残留垫层中收集病毒,将碘克沙醇浓度调整至25% (w/v),病毒在Beckman NVT65(近垂直转子)中以35万g的浓度条带3 h。
核衣壳来自1% NP-40(在含2 mM EDTA的缓冲盐水中)处理过的柱状病毒悬液(6 ml),可以在双层碘克沙醇梯度上分离(3 ml, 25% w/v和50% w/v),以16,000 g离心3 h。
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