在开发 PROTAC 前,通常需要确定合适的靶点,将其敲除后,可获得目标表型。HaloPROTAC3 可通过介导HaloTag®(HT)融合蛋白的靶向降解来轻松实现对降解表型的评价。


▍▏检测工作流程


▍▏确认靶蛋白降解是 PROTAC 介导的 VHL 参与的机制

对映体化合物ent-HaloPROTAC3 可与 HaloPROTAC3 配合使用,其可用于确认 HaloTag® 融合蛋白的确是通过 VHL 参与的 PROTAC 机制被降解。ent-HaloPROTAC3 与其对映体分子量相同,且基本结构也相同。

然而,D- 羟脯氨酸(D-Hyp)和 D-缬氨酸(D-Val)残基修饰可对其与VHL 的结合造成显著影响(图 A)。

以 CRISPR 编辑 HEK293 细胞,使细胞共表达 HiBiT- HaloTag® -BRD4融合蛋白及 LgBiT 亚基。使用不同浓度的 HaloPROTAC3 变体处理细胞。同时对重组 BRD4 的蛋白浓度水平进行了实时监测。HaloPRTOAC3 处理产生了与浓度相关的靶蛋白损失,但ent-HaloPROTAC3 处理组,却未检测到蛋白降解(图 B)。


▍▏Wnt/β-Catenin 模型系统

β-Catenin(β- 连环蛋白 ) 是经典的 Wnt 信号通路的重要组成物质。通过该临床相关通路,细胞可整合外部信号,实现对胚胎发育的全面控制。在非刺激条件下,β- 连环蛋白与 β- 连环蛋白破坏复合物发生结合,并发生磷酸化。这可使 E3 连接酶 β-TrCP发生聚集,并导致 β- 连环蛋白发生多聚泛素化和蛋白酶体降解。Wnt 配体与膜受体 Frizzled 发生结合时可激活了这一信号通路,进而促进 β- 连环蛋白的胞质聚集,并随后促进其发生核转位。此时作为转录共激活因子,β- 连环蛋白通过与 T 细胞因子 / 淋巴增强因子(TCF/LEF)转录因子发生结合,启动Wnt 应答基因的转录。


▍▏靶蛋白丢失与表型之间的联系

转录共激活因子 β- 连环蛋白是 Wnt 信号通路的关键组成物质,使用 HiBiT-HaloTag® 对其进行内源性标记。(图 A)使用 HaloPROTAC3 进行处理后,所获结果证实了靶蛋白降解与时间和剂量的相关性。(图 B)利用含 TCF 响应元件(RE)的萤火虫萤光素酶基因报告质粒,检测 HaloPROTAC3 处理导致的对 mWnt3a 诱导的 β- 连环蛋白 /TCF 介导的转录的抑制作用。


▍▏产品包装内容

HaloPROTAC3

ent-HaloPROTAC3 (Negative Control)

HiBiT-HaloTag® CRISPR Donor Vector (N-terminal)

HaloTag®-VS-HiBiT CRISPR Donor Vector (C-terminal)

HaloTag® CRISPR Donor Vector (N-terminal)

HaloTag® CRISPR Donor Vector (C-terminal)

Janelia Fluor® 549 HaloTag® Ligand

Janelia Fluor® 646 HaloTag® Ligand

LgBiT Expression Vector

检测试剂

• Nano-Glo® HiBiT Lytic Detection System

• Nano-Glo® HiBiT Blotting System

• Nano-Glo® Live-Cell Assay System (0 – 2 h)

• Nano-Glo® Vivazine™ Substrate (2 – 24 h)

• Nano-Glo® Endurazine™ Substrate (2 – 72 h)


▍▏相关产品列表

Nano-Glo® HiBiT 检测试剂

细胞内 LgBiT 亚基的表达

HaloTag® HiBiT 融合蛋白的降解

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