总蛋白染色


由于蛋白质在凝胶中不能直接可见,所以必须对凝胶进行染色。蛋白质通常用考马斯蓝或银染色。染色后的凝胶,可以使用合适的仪器进行成像(见第7章)来进行永久性记录。所捕获的图像可使用适当的软件进行图像分析。

对转印后的凝胶进行染色,确保蛋白质已经成功地从凝胶迁移到膜。如果蛋白质没有转移到细胞膜上,后续骤无需进行。对于某些应用,在电泳后只需直接分析凝胶中的全部蛋白质,例如,检查蛋白质纯化的质量。预染的另一种方法是在电泳前用荧光化合物标记样品,可以在电泳分离后直接进行成像。

银染:银染色是聚丙烯酰胺凝胶中蛋白质永久可见染色最灵敏的方法。在银染中,凝胶用可溶性银离子浸渍,并用甲醛处理,从而减少银离子,形成金属银的不溶性棕色沉淀。这种减少是由蛋白质促进的。银染色蛋白可以使用像Amersham 680这样的成像仪系统成像。

考马斯蓝:考马斯蓝染色是基于染料考马斯亮蓝的结合,它结合几乎所有蛋白质都是非特异性的。虽然它比银染色更不敏感,但由于其方便性而被广泛使用;凝胶仅浸入染料溶液中,任何脱胶染料可在脱胶步骤中从凝胶中扩散出来。考马斯蓝染色蛋白可以用Typhoon系列和Amersham 680等系统成像。

荧光预标记:荧光预染蛋白可以耦合蛋白及荧光染料,比如说可以在电转前预标记的CyDye(4)试剂盒。

Amersham QuickStain Kit该试剂盒中包含氟氯烃化合物和一种标记的缓冲液,可用于在断裂后和消除后的蛋白质并且可持久直接检测。此外,过量的Cy5荧光团通过凝胶比蛋白质更快地迁移到终止于凝胶底部,从而消除了凝胶脱胶的需要。有关详细信息,请参见11.2.5中的实验步骤。

图1显示了转移和随后的Western blotting分析前用cy5预标记的细胞溶解物样品的分离。除了快速,它也比银染色更灵敏,并且具有所有染色技术中最广泛的动态范围(图2)。荧光标签可以使用诸如Amersham Taphoon 5和Amersham Imager 680等系统进行分析。

图1  Cy5预标记反应。在室温下,将2.5、5.0、10.0和20.0μg CHO细胞溶解物的三份样品用1μl cy5预标记30分钟。Cy5试剂按1:20稀释,总体积为20μL。

图2   用cy5(a)预标记或用sypro-ruby(b)或coomasse(c)后染色的相同蛋白混合物(300ng)的SDS-PAGE分析。对比SDS页面和成像后的泳道图像,可以发现Cy5预标记提高了灵敏度,降低了背景和噪音水平。

表1 常见的的蛋白染料或标记的属性

蛋白染料或标记

检测方法

检测下线

动态范围

银离子

光密度值

荧光成像

~ 1 ng

~10

考马斯亮蓝

光密度值,

荧光成像

~ 10 ng

~102

SYPRO Ruby

荧光成像r

~ 1 to 2 ng

~102.5

CyDye

荧光成像

~ 0.25 ng

~104


参考文献


1. Schägger, H. and von Jagow, G. Tricine-sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis for the separationof proteins in the range from 1-100 kDalton. Anal. Biochem. 166, 368–379 (1987).

2. Wiltfang, J. et al. A new multiphasic buffer system for sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis of proteins and peptides with molecular masses 100,000-1000, and their detection with picomolar sensitivity. Electrophoresis 12, 352–366 (1991).

3. 2-D Electrophoresis, Principles and Methods, GE Healthcare, 80642960.

4. Bjerneld, E. et al. Prelabeling of diverse protein samples with a fixed amount of Cy5 for SDS-PAGE analysis, Anal. Biochem. 484, 51–57 (2015).

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