【Promega】MSI 分析系统和Y染色体缺失检测系统

【Promega】MSI 分析系统和Y染色体缺失检测系统

Microsatellite Instability (MSI) Analysis


说明

MSI Analysis System, Version 1.2(MSI 分析系统,1.2 版本)是一种以荧光多重 PCR 为基础的方法, 用于检测微卫星不稳定性(MSI),MSI 是一种基因组不稳定形式。这种不稳定性是由于在 DNA复制时重复单元的插入或缺失,并且错配修复系统 (MMR) 不能修正这些错误造成的。MSI分析主要涉及比较微卫星标记的等位基因图谱,这些标记是由相应的肿瘤和正常样本扩增产生的。若肿瘤样品中的新等位基因在相应的正常样品中不能检出,表明存在 MSI。

MSI Analysis System, Version 1.2 包括用于 7 个 Marker 的共扩增的荧光标记引物 (marker panel),以分析 MSI-high(MSI-H) 基因型 , 还包括 5 个几乎单态的单核苷酸重复 marker (BAT-25, BAT-26, MON0-27, NR-21 和 NR-24) 和 2 个高度多态五核苷酸重复marker(Penta C 和 Penta D)。可在光谱校正后使用 ABI PRISM®310,3100,3100-Avant,3130,3130xl 遗传分析仪检测扩增片段。

该配置符合 2002 NCI Workshop for MSI Testing 上所提的推荐标准,并且可克服通常在使用 5-marker Bethesda Panel 时出现的潜在的错误分类、缺乏灵敏性及影子带所带来的假象等问题。

通过 GeneMapper® 4.0 软件进行基因型的自动分配,panel 和bin 使数据分析简化和标准化。

特点

• 涵盖全部 MSI 表型:单次多重 PCR 可检测 MSI-H 中 5 个携带信息的单核苷酸重复标记。

• 样品鉴定可靠:高度多态五核苷酸重复序列的共扩增,可提供内部样本跟踪。

• 数据均一性高:GeneMapper® 4.0 软件的 panel 和 bin 文件可从以下网站下载:www.promega.com/techserv/tools/msi/。

储存条件:储存于 -20℃。

Y Chromosome Deletion Detection System,Version 2.0


说明

Y Chromosome Deletion Detection System, Version 2.0(Y染色体缺失检测系统,2.0 版 ) 为扩增人类 Y 染色体上包含的非多态性序列标记位点 (STS) 提供了标准化的扫描图谱。该系统扩增与AZoospermia Factor(AZF) 相关的关键功能区域,即以下区域:位于 AZFa 两侧,覆盖 AZFb, AZFc, AZFd 包括 DAZ, KAL-Y, SMCY及其两侧与精子发生相关的基因座,( 即 RBM1, DFFRY 和 DBY)。

该升级版本 2.0 系统包括增加的 STS,使其完全符合 European Molecular Genetic Quality Network(EMQN) 推荐标准。

其中包括 5 个 Multiplex Master Mixes,总计 20 种 Y 染色体特异的引物对。每 4 对复合引物组合包含一个对照引物对,这个引物对用于扩增 X 遗传关联的 SMCX 位点。其中的一组复合引物组合(Multiplex E Master Mix) 包含一个对照引物对,这一引物扩增男性和女性 DNA 共有的特殊区域 (ZFX/ZFY)。最后,Multiplex E Master Mix 包含一个扩增 SRY 基因区域的引物对,这一引物对作为 Y 染色体短臂上的睾丸确定因子的对照,用于检测由 Y 向 X 移位的 XX 男性。

这些 Multiplex Master Mixes 是为了便于同时扩增 Y 染色体的若干不同区域而设计的。5 个多重 PCR 扩增产物 (83-496bp) 可用琼脂糖凝胶电泳清楚地分离,并且用 EB(ethidium bromide) 染色可见。

如果 Y 染色体的特异区域扩增失败,则表明检测样品为 Y 染色体缺失。若 Y 染色体缺失是在用这些引物组合扩增的区域内,则与男性不育症相关。

使用片段大小对照 ladder,可缩短分析时间,并减小错误计算扩增产物分子量的可能性。

特点

• 易于使用:Premixed Multiplex Master Mixes 包含 20 个引物对,包括在结果中提供标准图谱的内参,而不需要用户的特别优化。

• 艺术级的分析:引物对符合目前 EMQN 的推荐标准,包括扩增SRY 的引物。

• 更稳定的反应:改良配方和使用 GoTaq® DNA 聚合酶,减小未被扩增的几率。

• 灵活性:配合 PE480 ( 需石蜡油覆盖 ) 或 PE9600/9700 ( 不需石蜡油 )PCR 仪,可对使用多种方法进行纯化的基因组 DNA 进行扩增。

• 完整系统:试剂盒提供了反应需要的所有试剂,除了 AmpliTaq Gold® ( 使用 PE9600 或 PE9700 时需要 )。

储存条件:储存于 -20℃。

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