【Cytiva】WB样本制备之样本清除
通常不必在1-D凝胶电泳之前对样品进行处理。然而,如果存在分离的问题,例如模糊带,则样品清除通过去除潜在干扰化合物如核酸、多糖和盐来提高纯化率。例如,DNA酶的添加用于对抗由核酸释放引起的粘度的问题。
表1提供了常见污染物的清单和处理它们的选项
表1
样品清洁产品
SDS-PAGE清洁试剂盒:用于制备由于存在盐或低蛋白质浓度而难以分析的样品(图1.1)。该试剂盒使用沉淀剂和共沉淀剂的组合来定量沉淀样品蛋白,同时在溶液中去除诸如洗涤剂、盐、脂类、酚类和核酸等干扰物质。蛋白质通过离心成球。将颗粒进一步清洗以去除非蛋白质污染物,然后再次离心分离。将所得颗粒重新悬浮,与SDS样品缓冲液混合用于聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE),并加热。然后样本就可以用于SDS-PAGE了。该程序可在2小时内完成。
图1.1 SDS-PAGE清洗试剂盒与乙醇沉淀法的比较
(a)用10体积乙醇沉淀尿蛋白。
(b)SDS-PAGE清除试剂盒沉淀尿蛋白。使用后发现更多更强的条带。SDS-PAGE清理试剂盒由于有效的沉淀过程,试剂盒是基于凝胶:8×9厘米,丙烯酰胺12.5%,SDS 0.1%,在SE260微型垂直电泳运行。染色:考马斯蓝R 250。
2-D清洁试剂盒设计用于制备2-D凝胶电泳样品(图1.2),但也可用于Western印迹应用。试剂在溶液中定量蛋白质产物,同时去除干扰物质,如洗涤剂、盐、脂类、酚类和核酸。用2-D清洗试剂盒对样品进行处理,大大提高了2-D凝胶电泳结果的质量,减少了条纹、背景染色和其他假性结果。有关2-D清理试剂盒的更多信息,请参见GE(2)的二维电泳、原理和方法手册。
图1.2。2-D清洁试剂盒消除了大部分残留SDS引起的水平条纹。样品:用4% SDS,40毫米TrIS碱提取大鼠肝脏。第一向:大约20μg的大鼠肝脏蛋白,固定的胶条(pH 4~7, 7厘米)。EtTon®IPGPHOR 3等电聚焦电泳17.5 kVH。第二向:SDS-PAGE(12.5%),运行在SE 260垂直电泳(8×9厘米凝胶)上运行。染色:银染色试剂盒,蛋白质。
血清或血浆样品中高丰度蛋白背景降低
当用Western印迹法研究血浆或血清时,大量的血浆蛋白,如白蛋白和IgG可以掩盖蛋白质含量较低的信号。预填充柱如HITRAPμ白蛋白和IgG等填料被设计为这些潜在的有问题蛋白质的样品,分别可去除95%白蛋白和>90% IgG。
HITRAP白蛋白和IgG纯化1 mL柱设计为从约150μl未稀释的人血浆或血清样品中除去白蛋白和IgG,其含有正常的白蛋白水平(~40 mg/ml)和IgG(~15 mg/ml)。纯化过程需要大约35分钟,并且可以使用来自Sou-KTA平台、蠕动泵或手动与注射器的液相色谱系统来执行。当使用较小体积时,推荐白蛋白和IgG纯化SPInAPP,设计用于体积为50μL的人血浆或血清。
脱盐和样品浓缩
在将样品应用于电泳凝胶之前,溶剂不含有过量的盐或其他低分子量污染物非常重要。样品中的高盐水平会导致蛋白质迁移不一致和不可预知的其它问题。脱盐是在凝胶过滤的基础上实现的,同时将样品转移到所需的缓冲液中。然而,脱盐和缓冲交换过程常常导致样品稀释。所以在电泳应用中,需要很高的样品浓度以获得良好的结果,样品浓度需要提高。通过膜超滤可有效地富集样品。
由GE提供的脱盐和浓缩柱总结在表3中。
表3 GE的脱盐产品
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