【IZON】qEV 尺寸排阻柱说明和操作指南

【IZON】qEV 尺寸排阻柱说明和操作指南

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qEV 尺寸排阻柱


功能

Izon qEV 柱从生物样品中分离细胞外囊泡。


适用于 qEV 的样品 ¹

血清、血浆、唾液、尿、细胞培养液

1 注意有些“原始”样品未经处理不得直接用于 qEV 柱或 TRPS 分析,需要进行至少两次样品离心(例如血、唾液)或浓缩(细胞培养液)。从 Contact support@izon.com 获得有关操作步骤的帮助。


选用 Izon qEV 柱的优势包括 ²

  • 约 15 分钟的分离时间

  • 极大程度地降低低蛋白复合物产生和囊泡聚集的风险

  • 可以使用生理等渗的缓冲溶液

  • 是一种温和、快速的方法,可以最大程度地维持囊泡的生物学功能

  • 囊泡回收率为 50% 或更高

  • 蛋白的去除比 >1000 倍

  • HDL 纯化 >8 倍

2 A.N Böing et-al; “Single-step isolation of extracellular vesicles by size-exclusion chromatography”, Journal of Extracellular Vesicles 2014, 3: 23430


说明书

参数

数值 / 说明

样品体积

≤1 mL,500 μL为获得最高纯度 EV 的优化体积

空隙体积

3.0 mL ± 0.25 mL

操作温度

15–25 °C

流速

18 °C 时通常为 0.8–1.2 mL/min

分离尺寸

70 nm

缓冲液

PBS

床层体积

10 mL

最大可通过尺寸

1 μm

顶部和底部过滤尺寸

20 μm

纯化 pH 范围

3–13

清洗 pH 范围(CIP)

2–14

保质期

3 个月(适当保存)

第一次使用后的寿命

取决于使用方法与保存方法


操作流程³


安全预防

  • 当使用 qEV 柱时需采取适当的个人防护措施,如实验服、手套和防护镜。

  • 柱子的抗菌溶液包含 0.05% w/v 的叠氮化钠,大量叠氮化钠有毒,需避免皮肤和眼睛直接接触。

  • 废弃缓冲液应妥善处理,叠氮化钠会在铜制管道中累积引发爆炸。

  • 生物样品可能存在危险,使用 qEV 柱时需向实验室安全员咨询样品安全操作要点。

3 qEV 尺寸排阻柱只用于研究目的。


保存

柱子保存在含有抑菌剂(例如 20 %乙醇,或<0.05 % w/v 的叠氮化钠)的溶液中,存放于+4到+8 °C。抑菌剂可以在冲洗步骤时引入(见囊泡收集后部分)。


使用前

如下图所示:

  1. 将柱子固定,使液面水平,确保柱子垂直放置。

  2. 不要移除底部滑动盖。

  3. 小心缓慢地移去顶盖。


柱子的平衡

  • 移除底部滑动盖,并且使用至少 10 mL 洗脱缓冲液(PBS)冲洗柱子。如果不是使用PBS 洗脱,那么至少使用 30 mL 洗脱缓冲液冲洗柱子。记下 5 ml 缓冲液通过尺寸排阻柱通过的时间,这可用于判断何时需要清洗柱子。

  • 确认有充分的平衡时间使柱子温度介于操作温度范围内。

  • 不要使柱子变干。顶部的筛板必须保持湿润。柱子变干会影响其功能。

  • 使用当天新配的过滤(0.2 μm)缓冲液避免引入颗粒物污染。

  • 为了最好的结果,建议购买 Izon Prep andReagent 试剂盒。

  • 如果在操作温度范围之外使用,可能会得到错误的结果。

样品的纯化

1. 样品的引入的应用

⑴在移除柱子底部滑动盖前,使用移液枪移除筛板顶部的缓冲液。

⑵加入 500 μL 样品。

⑶立即移去底部滑动盖。

⑷立即开始收集 0.5 mL 馏分:

  • 最开始的六个馏分(3.0 mL)为空隙体积,不含囊泡,通常无需分析。

  • 建议将空隙体积收集于同一个收集管中来节约时间,并可避免 6 个单独管子带来的测量误差。

⑸当最后的样品刚刚进入柱子顶部筛板(与之相平)时,加入更多缓冲液,但是不要高于顶部筛板 2 mL。

  • 等待直到最后一滴样品刚刚进入柱子顶部筛板,避免样品稀释。


2. 样品馏分收集

按照操作流程使用 qEV 柱时,EVs大多数洗脱于馏分 7、8 、 9 中,去除了~99.8 %的蛋白;

大于 10 的馏分包含更多的蛋白和更少的囊泡,不建议分析。为了得到更高的 EV 回收率,馏分可以合并起来,但合并馏分会稀释 EVs 的浓度。

方法 A — 得到最高的纯度和浓度

不同的样品会得到不同的洗脱峰形,因此建议预先测量 EV 浓度并对所有馏分(7 - 11)进行蛋白纯化。

⑴空隙体积之后立即收集 3 个囊泡馏分,每个馏分 500 μL(馏分 7、8 和 9)。

⑵测量每个馏分的 EV 浓度(使用 Izon qNano)和蛋白纯度。

  • 为了得到高浓度囊泡,使用 EV 浓度最高的馏分(通常 7 和 8)。注意:合并馏分会稀释 EV 浓度。

  • 为了得到高纯度囊泡,使用最低蛋白浓度的馏分。

方法 B — 一般使用操作

空隙体积之后立即收集一个囊泡馏分,1500 μL。为了减少蛋白污染,建议只收集 1000 μL。


3. 囊泡收集后

当收集完囊泡馏分之后,用至少 10 mL 缓冲液冲洗柱子,并按照《保存》部分的要求保存柱子。记下 5 mL 缓冲液通过尺寸排阻柱所需要的时间,这对于检测何时清洗柱子很有用。流速的改变可能暗示柱子被堵住或被污染。


qEV 柱的维护

再次使用

如何检测柱子何时被污染并需要清洁;

  • 流速相比初始流速开始变缓。因此建议测量初始冲洗流速(和/或空隙体积)作为对比。

  • 如果较先前相似的样品来说回收率明显下降,那么期望的 EVs 产率也相应下降。如果是这样,使用 Izon CPC100 校正颗粒(稀释于 PBS 缓冲溶液中),收集馏分并使用 qNano 测量至少 2000 个数。两个峰值馏分的回收率应该 > 50%。

  • 在冲洗完后,柱子顶端有颜色的变化。


注意

  • 对于新的柱子和干净或再生的柱子,顶盖和凝胶表面之间的空间说明储存过程当中凝胶有所沉降,并不影响其性能。为了使样品的稀释影响最小化,可以将顶盖向下推动 < 2 mm。

  • 当囊泡馏分随后被用于 PCR 或 RT-PCR 时,建议柱子单次使用。


柱子的再生

通常使用 20 到 30 mL 缓冲液清洗柱子,随后使用新缓冲液平衡柱子(如果更换环境)。

在一些应用中,变性的蛋白或脂质不会在再生步骤中被洗脱下来。可以通过下面的清洗步骤来去除。


柱子的清洗

去除沉淀蛋白、非特异性吸附蛋白和脂蛋白

用 10 mL 0.5 M NaOH 清洗柱子,然后用至少 30 到 50 mL 缓冲液冲洗柱子,并检查洗脱溶液 pH。

去除强非特异性吸附蛋白、脂蛋白和脂质

用 20 mL 非离子型表面活性剂溶液,如 0.1 % Triton X-100 清洗柱子,然后用至少 20 到 30 mL 缓冲液冲洗柱子。

在某些情况下,一些样品仍会残留痕量蛋白。在清洗结束时再次检查蛋白含量,如果蛋白水平高于预期,再清洗一次。


柱子的消毒

消毒可以最大程度减少凝胶的微生物污染。用10 mL 0.5 M NaOH 清洗柱子。然后用 30 到 50mL 无菌缓冲液平衡柱子,并检查洗脱溶液pH。


注意

• 脱气缓冲液有助于避免凝胶基质中气泡的产生。少量的气泡(<10)对柱效影响极小。

• 建议使用 0.15 M 或更高离子强度的缓冲液,以避免溶质与凝胶基质之间产生不必要的离子相互作用。

• 为了避免尺寸排阻柱的堵塞,建议过滤或低速离心生物样品以去除大颗粒物。


普通 EV 来源的样品准备步骤

普 通 EV 样 品 的 应 用 手 册 和 操 作 步 骤 见www.izon.com。如果不确定如何准备样品,请联系技术支持 support@izon.com。


柱子的性能指标


囊泡的峰值洗脱

  • 对于 500 μL 的样品体积,囊泡的洗脱峰值在 4.0 mL ± 0.5 mL。

  • 两个峰值馏分的回收率大约 50 %。

  • 对于 500 μL 的样品,峰值馏分通常在馏分 8 和 9 之中。如果希望更高的纯度,可以只收集最早的峰值馏分。

  • 通过测定 280 nm 处的紫外吸收可以得到 qEV 柱的蛋白洗脱图。通过 Bradford 法可以准确测定每个馏分中蛋白的精确含量。图 1 展示了当 500 μL 血浆样品上样至柱上时的囊泡洗脱图。每个馏分的囊泡浓度通过 qNano 测量,蛋白含量通过 280 nm 处的吸收值来测量。

图 1. 典型的 qEV 柱的洗脱图;蛋白洗脱的馏分晚于囊泡洗脱的馏分。


囊泡的富集是十分明显,它们主要存在于馏分 7、8 和 9 中。血清蛋白的洗脱更慢一些,主要存在于馏分 11 - 30 中。大于 10 的馏分通常含有高浓度的蛋白和低浓度的囊泡,不建议用来做分析。

EVs 的洗脱始于馏分 7,馏分 8 和 9 的浓度达到最高。收集越多的馏分,EVs 的总回收率越高。

图 2 血浆中 EVs 的回收率说明了这点。但是,收集的馏分越多,EV 的回收浓度就会越稀释。见表 1。


图 2. 用 CD61 生物标志物测量的累积 Evs 回收率。

误差条表示标准偏差。


上样体积

上样体积越大,囊泡馏分中的囊泡纯度越低。图 3 展示了血清上样体积为 100 μL,500 μL 和2000 μL 时的囊泡分布。2000 μL 的样品导致囊泡最大程度地被蛋白污染。2000 μL 样品中外泌体的出峰延迟显而易见。


图 3. 血清上样 100 μL 至 2000 μL 的囊泡洗脱图。


为了得到更纯的 qEV,建议最佳的样品体积为100 μL 至 500 μL,这样囊泡会洗脱于馏分 7 至9 之中。

图 4 展示了血清上样体积为 100 μL 和 500 μL 时的囊泡洗脱图。

图 4. 血清上样为 100 uL 和 500 μL 时的囊泡洗脱图。

囊泡的尺寸分布为 70− 300 nm。


囊泡的损失发生在当样品体积大于 500 μL 时,囊泡的洗脱峰很宽以至于一些囊泡从馏分 11中被洗脱下来。这些馏分不建议用来分析因为包含了大量的干扰蛋白。


纯化

图 5 展示了馏分 7 到 9 之间含有很少量的蛋白,且越后面的馏分中蛋白含量越多。


图 5. 馏分中蛋白含量占起始蛋白含量的百分比,误差条是七个柱子中测量蛋白含量的标准偏差


图 6 展示了经过 qEV 柱纯化后,EVs 相对于蛋白的纯化度。每个馏分的纯化因子(纯化前后蛋白的减少比例)如图所示。馏分 7 和 8 富集的 EVs 最多,也就是相对于回收的囊泡来说大部分蛋白被除去。


图 6. 经过 qEV 柱纯化后,EVs 相对于蛋白的纯化度。


qEV 柱纯化过程中的稀释

为研究 qEV 纯化过程中对样本的稀释,用已知浓度的聚苯乙烯纳米颗粒标准品和脂质体来模拟 EVs 的尺寸和组成。

稀释因子取决于哪些馏分被合并起来。起始体积为 500 μL 的聚苯乙烯纳米颗粒标准品(直径众数为 400 nm)的总回收率为~100%。

图 7 说明合并馏分 5 至 11 可以得到 100% 的颗粒回收率。这导致稀释因子为 7,并且收集的馏分含有大量的干扰蛋白,因此不适于实际应用。

图 7. 400 nm 聚苯乙烯纳米颗粒标准品的洗脱图。

表 1 展示了收集不同馏分的稀释因子以及回收率。

虽然可以获得 100% 的回收率,但是也可以通过测量每一个馏分的颗粒浓度,将浓度最高的两个馏分合并起来。因此回收率与纯度之间存在折衷。当将馏分 7 和 8 合并起来时,脂质体实验的回收率为~50 %,与聚苯乙烯纳米颗粒的结果相一致。

表 1. 稀释效应是馏分合并与回收率的函数。


依据 EVs 的最终浓度,可以不稀释馏分,直接用 qNano 来测量每个馏分的浓度。对于 qNano,每分钟 500 到 1600 个颗粒是最佳速率。如果样品速率高于这个范围则需要进行稀释。

如果依据这个操作步骤来使用 qEV 柱,并且每个馏分的体积很精确的话,EVs 会始终洗脱于馏分 7、8 和 9,而馏分 10 和 11 中的含量很少。


操作温度

qEV 柱经过严格的质量控制,流速大约 1 毫升 / 分钟(±0.2 毫升 / 分钟)。对于一些样品来说,操作温度可能会影响流速,最终影响 EVs 的洗脱峰形。

回收率的优化温度为在 15 ℃ 和 25 ℃ 之间,因此推荐的操作温度为 15 - 25 ℃。


大体积样品的操作⁴

对于一些生物流体来说,qEV 纯化前,可以通过将样品预先浓缩来获得更多的外泌体。根据所使用的样品和其它制备步骤,此操作步骤可以根据需要相应修改。

1)取定量的细胞培养液,将样品离心 1500 g,10 分钟,随后离心 3000 g,10 分钟,取上清液。对于细菌细胞来说,则需要更高的离心力。

2)用 Merck Millipore 离心装置或等同的装置来浓缩细胞培养液。Amicon Ultra 15 是一种 50 mL Falcon 类型装置,需要很低的离心转速,最高 4000 g。这样的话每次离心需要 15 分钟。这个装置可以将 15 mL 液体浓缩至 300-500 μL。

3)如果样品中含有不溶物,在 qEV 纯化前 10,000 g 离心 10 分钟,去除沉淀。否则这些沉淀会对后续 TRPS 分析造成影响。

4)样品经过以上浓缩便可以按照上面第二部分来进行 qEV 纯化了。

4 这里提供的浓缩步骤仅供参考,具体实验步骤还应根据实际样品的情况进行调整


qEV 馏分的 TRPS 分析

对于 TRPS 分析来说,Izon Science 推荐使用 Izon 试剂盒,这个试剂盒可以用来预涂纳米孔并可以在整个操作过程中使用。

在 TRPS 的准备阶段和操作阶段中,需要过滤所有试剂以避免污染或者大颗粒对 TRPS 浓度测试的干扰。Izon Science 推荐使用当天新配的过膜(0.22 μm 注射器式滤器)试剂。

用 TRPS 分析 qEV 馏分时,Izon Science 推荐将馏分在初始电解液稀释 1/5 或 1/10。优化稀释比例,使得最高压力下的通过速率为约每分钟 500-1600 个颗粒,以避免纳米孔堵塞。

如果对于 TRPS 分析来说囊泡浓度过低,需要浓缩样品(见下面)。下面部分介绍 qEV 馏分收集后的样品浓缩。


qEV 馏分收集后的样品浓缩

对于小体积样品或对于少 EVs 的样品来说,浓缩囊泡可以使分析变得更简单。下面的方法可以在 0.5 - 1 h 之内浓缩收集到的囊泡。

通过 Merck Millipore Microcon-30 装置浓缩小体积样品(需要实验室离心机达到 14,000 g 的离心力)。可以将 0.5 mL 样品浓缩至大约 200 μL。可以重复浓缩获得更多的样品(比如馏分 7-9)。


术语表

色谱:一种样品中成分分离的方法。由固定相和流动相组成,样品的各组分在两相之间分配。固定相可以是固体,固体支持液体或凝胶。固定相可被填充在柱中,伸展为固定层或分布为薄膜。流动相可以是气体或液体。

柱体积:填充材料和空隙体积的体积和(可简称为床体积)。

馏分:表示从柱上收集的特定体积,对于给定体积数值恒定。也就是说,馏分 7 的 0.5 毫升是指收集的 3.0 毫升至 3.5 毫升中的 0.5 毫升。

脱气:指将溶液抽真空来 “煮” 掉多余的溶解气体,如将烧瓶抽真空。

流速:载液的体积流量,单位为 mL/min。

空隙体积:柱中固定相的总体积;柱子的其余部分由凝胶材料填充。它表示了 SEC 的排除体积。

囊泡馏分:囊泡出现在的馏分。

回收率:囊泡从柱子流出的量与进入柱子的量的百分比。

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